La comunidad Santa Rosa de los Épera fue parte activa de una investigación realizada entre la comunidad y otras organizaciones. La investigación pretendía visualizar las principales problemáticas de esta comunidad a fin de plantear un trabajo de incidencia que responda a las necesidades más inmediatas.
Entre los principales hallazgos de la investigación se destaca la invasión, por parte de los colonos, en sus zonas protegidas. Esta problemática implica que los dirigentes deban salir a ciudades como Quito o Esmeraldas para hacer las respectivas denuncias. Esto, además, representa gastos económicos con los que la comunidad no cuenta, por lo que los procesos no tienen seguimiento y las invaciones continúan.
Además, se puso en envidecia la contaminación de sus ríos por actividades mineras y de agroindustria, especialmente, de palma africana. La comunidad identifica el prinicipal núdo crítico de contaminación en la cabecera del Río Cayapas.
